Das anthropologische Museum ist auf die Kulturen im Südwesten der USA und in Mexiko spezialisiert. Die Ausstellung im Nordflügel ist der Geschichte und der modernen Lebensweise der zehn Wüstenstämme (Seri, Tarahumara, Yaqui, Tohono O'odham, Yuma, Paiute, Pai, Apache, Navajo and Hopi) gewidmet. Im Südflügel umfasst eine Ausstellung über 350 mexikanische Masken. Im Museumsarchiv liegen über 100.000 Kunstobjekte.