Zwischen dem decumanus und den kaiserlichen Wohnräumen standen die religiösen Bauten: das Mausoleum, das dem Kaiserkult diente, und diesem gegenüber die Tempel der Venus und der Cybele (heute verschwunden) sowie der Jupitertempel. Um seine Macht zu festigen, behauptete Kaiser Diokletian, ein Nachkomme Jupiters zu sein. Der Tempel wurde im 6. Jh. Johannes dem Täufer umgewidmet und Ende des 9. Jh. in eine Taufkapelle mit beeindruckendem Taufbecken verwandelt. Der Sphinx vor dem Gebäude stammt ebenso wie der am Peristyl aus Ägypten.