Das Museum befindet sich an der Stelle des alten Spitals aus dem 16. Jh., von dem die Renaissancefassade und die Kapelle erhalten sind, in der die Ausstellung mit Sakralkunst untergebracht ist. Sehenswert sind u. a. die römischen Bodenmosaike aus Villen des 2. und 4. Jh. Die romanische Kunst ist mit Kapitellen aus der ehemaligen Kathedrale von Pamplona (12. Jh.) vertreten. Aus den darauf folgenden Epochen stammen Fragmente von Wandmalereien aus der gesamten Provinz. Ein besonders schönes Stück ist das spanisch-maurische Elfenbeinkästchen aus Córdoba aus dem 11. Jh.