In diesem Museum in dem im 19. Jh. entstandenen Flügel des Hieronymitenklosters sind Tonwaren, Waffen und Schmuck von den Anfängen der menschlichen Anwesenheit in Portugal ausgestellt. Sehenswerte Stelen und Menhir-Statuen aus der megalithischen Epoche und der Eisenzeit. Besonders gut vertreten ist die Römerzeit, z. B. mit der kleinen Bronzestatue der La Fortuna aus dem 1. Jh. Die Schatzkammer enthält eine große Sammlung an archaischen Goldschmiedearbeiten (Armbänder, Ohrringe u. a.).