Der Sitz der Universität befindet sich seit dem 16. Jh. in der Kapelle eines alten Klosters. Die alten Hörsäle sind noch erhalten, besonders auch im 1. Stock der sogenannte "Schwitzsaal", in dem die Studenten warteten, bis sie zur Prüfung vorgelassen wurden. Das Academisch Historisch Museum (Museum für die Geschichte der Universität) befindet sich in dem Gewölbesaal (Gewelfkamer) und veranschaulicht die Geschichte der Universität von Leiden seit 1575.